長江口深水航道治理工程是一項跨世紀的宏偉工程，是實施黨中央“以上海浦東開發開放為龍頭，帶動長江三角洲和整個長江流域地區經濟新飛躍”的重大戰略決策，是把上海建成國際航運中心的前提和基礎。長江口深水航道治理工程在河勢條件較優的長江口南港北槽內，采用整治與疏浚結合的方案，建設分流口工程、雙導堤及丁壩工程，采用疏浚措施開挖形成并維護深水航道。

    工程總投資約140億元，該工程規模包括建設堤壩141.484公里，航道水深由治理前的7米分三期逐步增深至8.5米、10米及12.5米，航道底寬為350～400米，可滿足第三、四代集裝箱船和5萬噸級船舶全天候雙向通航的要求， 兼顧第五、六代大型遠洋集裝箱船舶和10萬噸級滿載散貨船及20萬噸級減載散貨船乘潮通過長江口深水航道。

    南華參與監理了長江口深水航道治理工的一期、二期工程，監理標段工程規模包括過導堤、丁壩和疏浚工程相結合，使北槽航道通航深度達到8.5米，一期疏浚工程D1.1標、D1.4標將建設的航道全長18.11KM，雙向航道，航道底寬300m，橫斷面邊坡1：60，總疏浚工程量約為1370萬方；北導堤N38+000~N46+600段長8600米，丁壩N9長1500米，N10長300米。

          長江口深水航道治理工的一期、二期工程，獲“2005年國家優質工程金質獎”、“第八屆中國土木工程詹天佑獎”、“2008年度國家優質工程金質獎”、“2009年度交通運輸部水運工程質量獎”、“新中國成立六十周年百項經典暨精品工程”、“2011-2012年度國家優質工程銀質獎”等榮譽。